汉巴南高铁线路全线长148.04km，设计速度250 km/h，共设6座车站，采用调度集中控制方式。中国铁路成都局集团公司（简称成都局集团公司）调度所新设汉巴南行车调度台，管辖1个既有站（南充北）、1个存车场（南充北存车场）和6个标准站（巴中东站巴南场、巴中西、马鞍、睦坝、蓬安西、强家湾所）。南充北存车场和南充北常态点灯运行，不涉及点灯操作需求。6个标准站为常态灭灯运行。其中，南充北—强家湾所无区间信号机，所有6个标准站接发车进路均为基本进路，无进路信号机。
原设计本线信号系统主要由列车调度指挥及调度集中、列车运行控制、区间闭塞、联锁、信号集中监测、电源、防雷及接地等子系统构成。行车调度指挥系统采用中国铁道科学研究院集团有限公司调度集中系统（FZy-CTC），适用于CTCS-2级列控系统。区间采用基于ZPW-2000系列无绝缘移频轨道电路的自动闭塞模式，正向追踪运行，反向按自动站间闭塞运行， 动走线双方向运行，区间不设地面通过信号机。计算机联锁采用硬件安全冗余型，信号集中监测采用2020版。