是两个世界融合成一个。本来是一个世界分成2个，但是各自进化的方向不同，融合的话就会发生消灭现象！始源备份了一切，另外大家是因为害怕未来才有的梅比乌斯！

1代2代的世界融合，融合就是毁灭
前作各代主角团发明了始源，始源在世界毁灭后就能复活一切
世界毁灭当时，梅比乌斯诞生，Z控制了始源创造艾欧尼翁
然后发生dlc剧情，前作主角团只剩下了被囚禁的梅莉亚和沉睡的尼娅
本篇剧情，3代主角团打倒Z，解放始源，诺亚选择继续前进
艾欧尼翁初始化=结尾的两个世界分开
最后世界再次相撞，始源启动
ed后的小诺亚就是所有人复活后的未来，但是没人记得3代时期的记忆了

我是这样认为的
世界相撞融合要一段时间，这瞬间始源被骇入后启动
让应该在两世界完全融合毁灭后才诞生的三代提早出现
.
最后就是把三代世界取消掉，让两世界继续融合
至于怎么拉开的你别问，问就是始源

其实通关后的短片很明确了，两世界融合完成时间正常流逝后，广场上的小诺亚听到了那段艾欧尼翁安格努斯阵营的笛声，说明他们的命运再次交织在一起。

结局直接融合了呗，诺亚都听见MIO的笛声了
甚至说句难听点的，融合会消灭现象说不定本身就是艾欧尼翁错误模拟的，两个世界融合屁事都没发生，纯粹就是两个世界人想多了