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医学图像目标检测

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大佬们来救救孩子啊，研二下了，课题是高分辨率医学图像目标检测，根本不知道咋做啊，wsi图像上来就是几万像素，查了很多也看了很多，都说是分成512x512的patch，关键是咋搞啊，就算把分成patch了，那标注文件咋整啊，我快崩溃了，为啥我查不到有用的信息，已经卡了一个多月了


IP属地:四川来自Android客户端1楼2024-04-15 20:58回复
    来人啊
    IP属地:四川来自Android客户端2楼2024-04-15 22:09
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      将输入的图像切分成一个个小块。你设置左上角的为基准，其它块相对应的label只需要加上或减去固定个块的距离。如果预处理的时候做这些，你还会涉及到很多地方要和模型匹配，代码能力不强你把握不准。最简单的方法就是你直接把数据集分割成一块块数据集。我之前做过小目标检测以上是我的做法。
      IP属地:云南来自Android客户端3楼2024-04-15 22:46
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        我是能动的，不能指导你，但我是看别人的博士论文学的，感觉这个方法比较适用
        IP属地:北京来自iPhone客户端4楼2024-04-16 08:01
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          kaggle上有很多医学图像的比赛 很多大佬开源了代码 一般我都拿他们的代码做baseline 然后自己改
          IP属地:湖北来自Android客户端5楼2024-04-16 08:45
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            去看dota数据集怎么处理的
            IP属地:河北来自Android客户端6楼2024-04-16 09:18
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              我不是cv方面的专家，所以我给不了什么实际的建议，正如我刚刚说的我并不是cv方面的专家。不过你可以先收集下相关文献，找里面开源了代码的，看看他们预处理部分咋做的
              IP属地:安徽来自Android客户端7楼2024-04-17 07:58
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                找个能跑通的源码改
                IP属地:安徽来自Android客户端8楼2024-04-17 08:47
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                  虽然但是我建议直接用现成的SAM下手，觉得复杂可以转去Unet或者Transformer，huggingface都有可用的文档，用别人的代码训练就完事了
                  IP属地:山东来自Android客户端9楼2024-04-17 09:29
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                    SAM那边有专门的一个模型搞这个，然后提供了训练的Notebook代码，非常简单，你只需要整点COCO的训练集就是了，那不遍地都是
                    IP属地:山东来自Android客户端10楼2024-04-17 11:00
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                      没有patch level的标注?就假设你只有wsi上的标注吧，坐标转换一下就行了，可以看看openslide，pyvips这些io的库
                      IP属地:四川来自Android客户端11楼2024-04-17 13:24
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                        建议去看sahi这篇论文
                        IP属地:辽宁来自Android客户端12楼2024-04-18 19:19
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                          跟我研究方向一样，去github上找代码，数据处理部分可以参考Camelyon16挑战赛的相关项目，用openslide包处理wsi
                          IP属地:江苏13楼2024-04-22 13:19
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