大脑萎缩
长期患有抑郁症的患者的大脑特定区域：海马、丘脑、杏仁核、脑前额叶皮质等部分会有缩小的情况。这些区域的缩小程度和抑郁发作的严重程度和持续时间有关。
大脑这些区域的萎缩可能造成：记忆力降低、情绪感知能力降低、反应迟钝、情绪失控等严重后果。
大脑炎症
最近的一项研究表明[5]抑郁超过10年的人比抑郁时间短的人多30% 的概率患上大脑炎症。大脑炎症会让大量的脑细胞死亡，使患者的学习能力低下、注意力不集中、记忆损害、情绪失控。
大脑结构和连接的变化
持续性记忆、执行功能、注意力、和情绪调节功能都会因此而受到损害。这些变化至少需要八个月时间的持续抑郁状态才有可能发生。
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