公元950年前后，玛雅文明进入后古典时代。玛雅人移居到永久水源附近，人口大幅减少，许多城市被遗弃，只残存着塔巴斯科、佩腾伊察等城邦。
十三世纪初，曼科·卡帕克在安第斯山脉附近建立了一个小国——库斯科王国。1438年，帕查库蒂登基后，大力推行改革，并兴修桥梁、水利、道路。库斯科王国逐渐崛起，发展成为印加帝国。1470年，印加帝国吞并了位于太平洋沿岸的邻国——奇穆王国。之后沿着安第斯山脉不断向南北两个方向扩张。至1491年，印加帝国发展成了一个南北纵深近3500公里的庞大帝国。
1428年，位于中美洲的特诺奇蒂特兰、特斯科科和特拉科潘三座城邦结盟，形成了阿兹特克帝国。其中特诺奇蒂特兰城是帝国的核心，同时也是帝国的首都，它位于特斯科科湖中的一座人工岛之上，全盛时期拥有人口20－30万。十五世纪中晚期，在皇帝蒙特苏马一世和阿萨亚卡特尔的带领下，阿兹特克帝国对内改革，对外不断扩张，逐渐成为了中美洲的霸主。
十五世纪以后，北美的密西西比文化进入了文明晚期，战争和政治动荡加剧，人口流动不断增加。
除此之外，美洲还有易洛魁、普雷佩查、穆伊斯卡等文明。在草原和热带雨林中，分布着苏族人、科曼奇人、图皮人等部落与部落联盟……