中国中医科学院西苑医院的优势科室包括：
1、心血管科；2、老年病科；3、血液病科；4、脾胃病科；5、肺病科；6、肿瘤科；7、脑病科；8、外科；9、创伤科；10、肛肠科；11、风湿病科；
医院心血管科成立于1960年，为我国成立最早的中医和中西医结合心血管病专科。50多年来，围绕冠心病、慢性心衰、高血压病、心律失常、血脂异常、动脉粥样硬化等进行防治研究，积淀了丰富的诊疗经验，形成了显著的特色。
2023年，在“中国医院心血管病科技影响力百强”榜单中，中国中医科学院西苑医院荣列全国中医/中西医结合医院第1名，也是唯一入选全国综合性医院前50强的中医/中西医结合医院。