首先，「物に魂が宿る」是固定用法（搭配）。
以上面的前提来看，“「魂を宿って」”里，「宿る」是自动词，从助词接续来说，这个接续是错误的。
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但，回到原句：
「LOVE ROCKETS！ジュエリーの魂を宿って」
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通过分段进行理解的话，可以分成以下２段：
第１段、「LOVE ROCKETS！ジュエリーの魂を」
第２段、「宿って」
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第１段，有两点：
（1）「LOVE ROCKETS！ジュエリーの魂を宿って」可以看成：
「LOVE ROCKETS　に　ジュエリーの（定语）魂を」
从语法构架的角度来说，是没有问题的。
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（2）以助词为（宾格助词「を」）结尾的形式，是「助詞止め」。
「助詞止め」表示限定后续动词。
「助詞止め」在日语语境里，同时代表可以通过助词，判断后续动词。
所以，往往就没有必要继续后缀档次，再所以，后续动词就可以省略了。
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自此，光看语法，「LOVE ROCKETSにジュエリーの魂を」后面可以补上他动词「宿（やど）す」。
同样，“只是”从语法结构来说，这样“也”是没有任何问题的。
即，语法结构「〇〇に〇〇を（他动词）」，不存在任何问题。
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第２段，也有两点：
（1）承上
「〇〇に〇〇を（省略，他动词）」是没有任何语法结构的问题。
但，这个语法结构并不是「物に魂が宿る」这个惯用句的结构。
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不知道有没有听过：
①『北斗の拳』OP１「愛をとりもどせ」
结句部分反复：
「微笑み忘れた顔などを見たくないさ、愛をとりもどせ」。
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②『聖闘士星矢』OP１「ペガサス幻想（ファンタジー）」
开头部分的：
「抱きしめた　心の小宇宙（コスモ）　熱く燃やせ　奇跡を起こせ」
以及结句的：
「今こそ　はばたけ」
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从数据的量来说，可能不充足。
但可以看出，在歌词里，宾格助词「を」后有使用命令形的倾向。
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（2）「宿って」
「て」表示轻微的命令、请求。
自动词的连用形接续助词「て」，或自动词的「テ形」，表轻微命令、请求，是经常可以看到的。
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这里的表示轻微命令、请求的「て」，
与上面叙述的歌词里「を」后接续命令形的倾向吻合。
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综上推断，作者可能是为了：
1、维持「物に魂が宿る」的惯用型
2、维持「○○に○○を命令形」的语法构架
才写成了「LOVE ROCKETS！ジュエリーの魂を宿って」。
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至于为什么不是动词命令形「宿れ」，而是使用表示轻微命令、请求的「て」，可能考虑的是「魂」的属性问题。
如宝石般的灵魂，可能是轻灵的，也可能是不以凡人命令所动的。
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以上完全是个人感想，欢迎评论和指正。