法庭得知死刑犯被劫的消息后大为恼火,又受到教会的挑动,于是扬言一定要捉拿少女,派官兵到处搜捕。乞丐们闻讯后,都纷纷前来营救,决定冲进圣母院救出埃斯梅拉达,杀死卡西莫多。一心想要巩固王位的国王路易十一得知暴动的真正目的后,下了一道“把平民杀尽,把女巫绞死”的诏令,坚决镇压暴动,致使圣母院门前横尸遍地,周围变成了一片血海。无赖汉们围攻主教堂的时候,埃斯梅拉达正在睡觉,惊醒后看见面前站着两个黑衣人。一个是她的“丈夫”格兰瓜尔,另一个则一直默不作声,带着他们来到滩边坐船离开。
靠岸之后,格兰瓜尔带着女孩的山羊离开,而埃斯梅拉达则被陌生人拉着,一路狂奔,来到了广场中央的绞刑架前。陌生人掀起风帽,女孩这时才认出这正是屡次企图侵犯她的副主教克洛德。这位副主教对埃斯梅拉达进行最后威胁:要她在自己和绞刑架之间作选择。又一次被拒绝后,他把女孩交给一位隐修女看管,自己则去找禁卫军告密。年迈的隐修女无意间发现眼前这位漂亮的姑娘竟是自己寻找了15年的女儿。军队也在这时赶到,领队的正是菲比斯。百感交集的母亲奋力保护自己的女儿,在一阵混乱中,头撞石板而死。而无辜的姑娘最终也没能逃脱被绞死的厄运。