在P4G中，玩家将扮演高中生主角“鸣上悠”（动画版官方用名），从大都市转学到名为“八十稻羽”的小镇，进行为期一年高中学习生活。在这过程中，通过调查小镇上发生的一连串神秘案件，以及深夜电视中出现的异世界，主角会逐步邂逅多名性格迥异的角色，并与之产生羁绊，从而帮助自己调查事件背后的真相，完成命运的逆转。

和续作P5一样，玩家在本作中的游戏流程，依旧围绕着高中生日常生活以及迷宫探索，这两大核心主题展开。而这两大核心主题，又由游戏中所谓的人格面具，而被紧密联系在一起。
人格面具，即游戏标题中出现的Persona，出自著名的心理学流派——荣格心理学。该流派将人的心理统称为人格，并划分为三个层级；意识、个体无意识、集体无意识。影射到“女神异闻录”系列游戏中，就是当故事中的角色能够意识到自己的真正想法时，会由个体无意识转变为有意识，从而觉醒自己的人格面具。玩家所扮演的主角，作为天赋异禀之人，要做的，就是在调查异世界案件的同时，帮助身边的同伴解开心结，觉醒人格面具，通过提升与角色的好感度，来培养羁绊，并最终扭转整个社会的“集体无意识”现状，实现自己“逆天改命”的目的。这看似中二的设定，倒是与主角高中生的身份配合地恰到好处。