华沙军事检察院公布的理由是“他的活动是出于更高的需要,是为了有效地保卫波兰免遭核武器的打击。他从事情报活动的真正目的是为了波兰的利益”。而根据波兰刑法典第23条第1款,如果是为了避免公共利益和个人受到最直接的危险而采取避险活动,这种措施又是无法用其他方法取代的,且被挽救的损失大大超过牺牲的价值,其活动不构成犯罪。这实际上承认了库克林斯基是服从更高的民族自由、存亡而做出看似“叛国”的抉择,恰恰是爱国之举。
库克林斯基表示欢迎这一结果,但也苦涩地表示这对自己来说,只有象征意义了。此后,他多次重返故国访问,并先后被克拉科夫、格但斯克等波兰城市授予“荣誉市民”称号。2004年2月11日,垂垂老矣的库克林斯基在佛罗里达州的坦帕去世,中情局为他在天主教堂举行了追思弥撒。数月后,他的遗体被归葬华沙的波乌斯基军人公墓,长眠于他长子的墓碑之侧。值得一提的是,这一国家公墓所葬的均为19世纪以来为国牺牲的波军将士。同年,波兰总统追授库克林斯基将军军衔。