江户时代,日上山,年幼的麻生博士结识巫女白菊,白菊对幼年麻生产生好感,孤独的永生使她渴望麻生永远的陪伴。长大的麻生博士痴迷研究民俗,淡忘了白菊,重回日上山采风,与巫女逢世一见生情,但是两人分开之后奔向各自的命运。
拥有最强灵力的逢世,在麻生博士离开后,作为永生的人柱力,装入柩笼镇压着夜泉,命运之轮开始转动。日上山巫女悉数被杀,她们死后的怨念与来此地自杀的人怨念,一并注入夜泉之中,逢世通过夜泉化解这些怨念,但还是超过了负荷。人柱力逢世倒塌,夜泉喷涌而出,山鸣地动。身单影只心力交瘁的逢世,渴望与人冥婚增强灵力,但只愿意与带走了她的心的麻生博士结合,无数次的冥婚便都不成功,放生莲的朋友一哉也成了牺牲品。逢世堕入夜泉,无法自拔,求生不得求死不能,终于被夜泉侵蚀而黑化,寻求他人陪葬。
拥有灵力的夕莉,在孤独恐惧的驱使下,去往日上山结束生命。坠落夜泉中的逢世认定夕莉为救命稻草,虽然夕莉被密花救下,但仍然对夕莉百般呼唤。但随后夕莉救下了误入隐世的密花,两人羁绊加深,不离不弃。
深红与哥哥人鬼情未了,通过冥婚发生禁断之恋,生下了女儿深羽。之后,还是没能尽到做母亲的责任,抛下年仅三岁的深羽去往日上山。仪式过后,深红被沉入柩笼中的夜泉,由此进入隐世与封印住黄泉口的哥哥相聚。
深羽继承了母亲深红强大的灵力,因为过于思念母亲,一路追寻到日上山。她在历险中了解到自己的身世,也了解到身为夜泉子的悲剧命运,并与也有着悲剧命运的夕莉结下情谊。母亲的残存于世的气息极其微弱,历经万难找回了柩笼中的母亲,但夕莉通过读心发现深红心底另一种强烈的思念,这种思念超越了她与母亲相依为命的羁绊,这个事实让深羽几近崩溃。