猜测：
7万年前走出非洲后来到东亚地区的一支智人祖先，融合并淘汰了本地的残余扁平直立人。
此时的面部特征就已经是没什么明显的立体度了，并且面部的扁平几乎不怎么影响在这片地区的生存和繁衍，除了风沙容易进入眼睛。于是就慢慢进化出了细长的小眼睛。所以扁平的脸和小眼睛特征就这么来了。
我并不认为这个特征有多原始，因为甚至更原始的智人都更立体。而且，东亚人的面部特征恰恰说明了进化论的正确，生物压根没有什么精密的设计，而都是随机形成且刚好没被环境淘汰罢了。