生物医药十个专题会议：专题一：高通量虚拟筛选技术及在中药/天然产物挖掘药效分子中的应用专题二：CADD蛋白结构分析、分子对接、片段药物设计技术与应用专题三：人工智能技术及在生物分子活性预测、药物发现中的应用专题四：AMBER分子动力学能量优化与分析、结合自由能计算技术与应用专题五：GROMACS分子动力学蛋白模拟、药物开发溶剂筛选专题六：Rosetta从头蛋白抗体设计、结构优化及在药物研发中的应用专题七：集成多组学数据的机器学习

用MOE分子对接出来的50个结果进行构象聚类（同一化合物按照构象形状聚类）怎么搞

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专题一：CADD 蛋白结构分析、虚拟筛选、分子对接（蛋白-蛋白、蛋白-多肽等） 生物分子互作基础、蛋白数据库、蛋白结构分析、同源建模、 小分子构建、小分子化合物库、生物分子相互作用Ⅰ、生物分子相互作用II 、虚拟筛选、小分子格式转换、拓展对接使用场景（上）、拓展对接使用场景（下） 、基于碎片药物设计、构效关系分析、分子动力学模拟 专题课程二：AMBER 分子动力学能量优化与分析、结合自由能计算专题 分子动力学入门理/论 研究对

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我是猎头 上海找cadd研究员

蛋白结构分析、同源建模、虚拟筛选、分子对接（半柔性、柔性对接、蛋白-蛋白、蛋白-多肽、金属酶蛋白-配体、核酸-小分子、共价对接等）、药效团模型、定量构效关系、碎片化药物设计、Gromacs 分子动力学模拟与结果分析，并以实例讲解与练习为主，达到即学即用效果，帮助学员系统性掌握计算机辅助药物设计技术，助力学术研究； 还有交流群感兴趣可以交流讨论

CADD(Computer Aided Drug Design):计算机辅助药物设计，依据生物化学、酶学、分子生物学以及遗传学等生命科学的研究成果，针对这些基础研究中所揭示的包括酶、受体、离子通道及核酸等潜在的药物设计靶点，并参考其它类源性配体或天然产物的化学结构特征，以计算机化学为基础，通过计算机的模拟、计算和预算药物与受体生物大分子之间的相互作用，考察药物与靶点的结构互补、性质互补等，设计出合理的药物分子。它是设计和优化先导化合物的方法

专题一：集成多组学数据的机器学习在生物医学中的应用专题： 机器学习导论、python语言基础、深度学习神经网络、经典机器学习 及多组学应用、多组学联合分析与疾病分子机制、深度学习在多组学数据中的应用、机器学习+Science 专题二：AMBER分子动力学能量优化与分析、结合自由能计算专题 分子动力学入门理/论、LINUX入门、AMBER简介及安装、研究对象模型获取 分子动力学模拟、结合自由能计算、可视化软件、基于分子动力学的轨迹特征获取 基于能

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“计算机辅助药物设计技术与应用实践”系列专题 其一：CADD蛋白结构分析、虚拟筛选、分子对接（蛋白-蛋白、蛋白-多肽） 生物分子互作基础、蛋白数据库、蛋白结构分析 同源建模、小分子构建、小分子化合物库、生物分子相互作用Ⅰ、生物分子相互作用II 虚拟筛选、小分子格式转换、拓展对接使用场景（上）、拓展对接使用场景（下）、基于碎片药物设计、构效关系分析、分子动力学模拟。 公众号原文链接： https://mp.weixin.qq.com/s/oiA-36jzZaoNHF9M6VRM9w

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01培训背景 近年来，利用高性能计算机来进行药物虚拟筛选已经被广泛应用，计算机辅助药物设计可以提高药物研发的成功率，降低研发成本，缩短研发周期，是目前创新药物研究的核心技术之一。随着医药大数据的积累和人工智能技术的发展，运用AI技术并结合大数据的精准药物设计也不断推动着创新药物的发展。在新型冠状病毒的治疗方案中，通过一系列计算机辅助药物生物计算的方法发现一大类药物分子可以有效阻止新冠病毒的侵染，为治疗新

关于举办“计算机辅助药物设计技术与应用实践”系列专题培训的通知 各有关单位: 近年来，利用高性能计算机来进行药物虚拟筛选已经被广泛应用，计算机辅助药物设计可以提高药物研发的成功率，降低研发成本，缩短研发周期，是目前创新药物研究的核心技术之一。随着医药大数据的积累和人工智能技术的发展，运用AI技术并结合大数据的精准药物设计也不断推动着创新药物的发展。在新型冠状病毒的治疗方案中，通过一系列计算机辅助药物生物

CADD(Computer Aided Drug Design):计算机辅助药物设计，依据生物化学、酶学、分子生物学以及遗传学等生命科学的研究成果，针对这些基础研究中所揭示的包括酶、受体、离子通道及核酸等潜在的药物设计靶点，并参考其它类源性配体或天然产物的化学结构特征，以计算机化学为基础，通过计算机的模拟、计算和预算药物与受体生物大分子之间的相互作用，考察药物与靶点的结构互补、性质互补等，设计出合理的药物分子。它是设计和优化先导化合物的方法

CADD 计算机辅助药物设计技术与实践 计算机辅助药物设计是通过计算机模拟、计算和预算药物与受体⽣物⼤分⼦之间的关系，设 计和优化先导化合物的⽅法；近年来，计算机辅助药物设计已经取得⼀定成就，特别是在新冠肺炎爆发后，很多研究机构和企业采⽤计算机辅助药物设计⽅法辅助进⾏了很多研究⼯作。在新型 冠状病毒的治疗⽅案中，通过同源建模⽅法发布了新冠病毒的三维结构，通过药物靶标预测、筛 选出针对新型冠状病毒的药物，通过⼀

这里有以下几个学习知识： 一：CADD药物设计 讲解：pymol，同源建模，autodock分子对接，ZDOCK，sybyl等药物研发专用软件操作 二：基于受体配体的药效团建模--组合筛选 三：薛定谔 四：amber分子动力学 五：gromacs分子动力学 等等内容很多，就不全发贴吧上了，想看原文可以关注“科研讨论圈”公众号 有想学习的+VX18612390781 事先声明不是免费的哦具体内容也可以看公众号了解一下！

生物分子互作基础 1.生物分子互作用研究方法1.1蛋白-小分子、蛋白-蛋白相互作用原理1.2 分子对接研究生物分子相互作用1.3 蛋白蛋白对接研究分子相互作用 蛋白数据库 1. PDB 数据库介绍1.1 PDB蛋白数据库功能1.2 PDB蛋白数据可获取资源1.3 PDB蛋白数据库对药物研发的重要性2.PDB 数据库的使用2.1 靶点蛋白结构类型、数据解读及下载2.2 靶点蛋白结构序列下载2.3 靶点蛋白背景分析及相关数据资源获取途径2.4 批量下载蛋白晶体结构 蛋白结构分析 1. Pymol 软件介

关于“AI人工智能Python与药物发现和药物设计”专题线上培训班 时间：2021.05.27 （线上培训）周四 2021.05.28（线上培训） 周五 2021.06.05（线上培训）周六 2021.06.06（线上培训）周日 课程内容简介： Python入门 1.Python语言概述及其在生物、医药、金融数据分析领域的应用。 2.人工智能与机器学习简介(Indroduction)。 2.Python及Anaconda，Pycharm的安装使用 3.jupyter-notebook的使用，Python语法基础 Python编程 1.Python常用数据结构(list,dict,set,tuple)理论+操作 2.Python爬虫进行数

虽然知道如此，但是不知道怎么，还是愿意等下去 　　　--来自助手版贴吧客户端