因为安室透也就是降谷零目前还在酒厂卧底，波本身份依旧有效，而且一方面让黑田称呼代号也间接透露黑田也是参与调查酒厂甚至可能是安室透的直属领导；另一方面也算是对安室身份的保护。
至于赤井，他卧底身份早就暴露回归FBI，黑麦也就成为无效身份了，所以即使FBI也在调查酒厂，称呼赤井秀一也是本名而不是组织称号。

这是黑田的个人口癖，黑田也用伊织无我之前卧底时的假名“榊原”称呼伊织，而“波本”也正好是降谷零在组织中卧底的代号，二者性质完全相同。

黑田习惯称呼对方卧底时的假名

所以他是领导还是碰巧知情啊
突然发现酒厂要是把黑田绑了库拉索和牢宾就不会寄了

下个系列要动画化的京都篇有说