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感谢野兽先辈的总结
1、因为贫富差距日益严重的原因导致了世界上恐怖份子以及对应的恐怖袭击变得逐渐猖獗，为了减少反恐精英们的伤亡，世界上最权威的生物博士REX牵头开始进行“超级士兵”计划，但是计划开始之初雷克斯博士尽管进行了通宵达旦的研究却仍旧没有得到任何进展，直到他收到了一份来自欧洲的事件报告。该份报告提及了欧洲某个小镇（乔治村）出现了尸体行走的奇怪情况。REX博士从中看到了机会，立刻派遣人员进入该地区进行调查。
2、该地区在20世纪初就有一个以女巫狩猎为核心成立的秘密宗教（镇魂之地、暮色修道院、起源之地），传言该宗教规模大到甚至都要成立议会了，而当地政府为了确保自己的权力与发言权对该宗教进行残忍的屠杀与折磨。不知道是否是因为这些宗教成员的怨恨还是因为某种邪恶的未知力量，一种以尸体为宿主的病毒产生了，感染这种病毒的尸体会通过本能去传播扩散体内的病毒，病毒扩散之快以至于欧盟政府将该病毒和相关的消息全部封锁了起来。但REX博士认为“该病毒是天赐的宝贝，这样封锁起来是不公平的”，通过多方努力还是得到了该病毒的所有样本信息
3、REX建立了一个秘密的研究所B1区，对病毒进行全方面研究。直到有一天对博士研究感到疑惑的记者“杰西卡”以卧底的身份潜入了该研究所进行调查，结果查到了大量反人道主义的研究，并准备揭露REX的行径，但杰西卡还是被研究人员发现并成为了病毒的实验目标。
4、病毒被REX进行了大量的生物实验，最后形成的病毒产物也以REX的名字为命名。而该病毒确实能诞生出“超级士兵”，只不过实验受体失去理智并极具攻击性，将在场的工作人员全部击杀。收到该份报告的REX博士认为那些失控的人只是实验中产生的失败品罢了，并不是这个实验有问题，同意并认可了B1实验室的成果并安排了大量的测试对象，并将它隔离了起来。
5、而对该实验抱有反对态度，并决定阻止“超级士兵”的人员在美国成立新的恐怖组织AFC。某天AFC冲入了B1研究所屠杀了研究人员，并破坏研究设施。但AFC的人员受到了反恐精英们的反击，不得已发动了自杀式袭击，在研究室里安装了C4并引爆
（AFC代表人物——大卫布莱克：原本是SAS成员，自愿加入了超级士兵计划成为试验品，但是因为看到实在太多不人道的实验后对政府彻底失望。后面因为AFC进攻实验室和他们接触后，决定以提供情报为条件加入了AFC组织，向政府抗议。）
（引爆B1实验室的人——安娜：在袭击实验室前所有人认为安娜已经死了，结果后面因为炸了B1实验所，所有人才知道她没死并且和针对REX研究的恐怖袭击有关系）
6、爆炸造成了数十人的死亡，（生化1）而本来剑拔弩张的CT和T却在这时候看到奇怪的东西——一种分不清人还是动物的生物，那是在超级士兵计划中数百个已死亡的实验体中出现的产物——僵尸。它嗅到了活物的味道，并通过被炸毁的门出来袭击了在场的所有人。幸存者们开始逃离实验室，并向外发送救援请求，结果外面的救援人员在进入救援的时候，发现越往实验室深处前进，僵尸就越多。正当救援人员陷入到僵局的时候，一声爆炸后一个超级士兵（杰西卡）从实验深处里杀了出来。
7、虽然超级战士的诞生让世界为之哗然，但还是因为实验的不人道所以这个消息还是被封锁了起来。REX博士也因此受到了全球的谴责，一切实验成果和地位、金钱全部被剥夺了。但REX博士依旧我行我素，不见棺材不掉泪般沉溺于超级士兵的研究中。而因为被世界政府财团抛弃而山穷水尽的他还是选择了在偏远城市的废弃工厂（生化3地图、生化工厂）开始了实验，而当地的政府财团对REX产生了兴趣，在暗中资助了他帮助其继续完成“超级战士”的项目。
8、在此期间，REX的新研究所不光出现了实验体的逃离，甚至一些病毒通过下水管道泄露到了城市供水系统里。但当地的政府却掩盖了这一信息，对外宣称这只是一个传染病，他们正在进行应对，并且开始无视它。结果传染病后失踪事件开始日益频发。当地民众看到了原本荒废的工厂又开始运作，并看到有尸体出入后，上报了更上一级的政府，于是新的调查组发现该工厂俨然已经成为了一个源源不断产生僵尸的制造厂，而且在逐渐占领该城市。而当政府下令隔离的时候一切都已经晚了，病毒完全失控，于是这座繁荣的都市彻底沦为了一座“失落之城”。
9、在政府派遣了调查小组进入失落之城失去联络后，反恐精英们开始集结新的“反僵尸”部队，并组建了开发反僵尸专用的武器的研究所——宙斯盾研究所。该研究所不仅为反僵尸部队制造新武器，同时也在寻找治愈僵尸病毒的方式。