我是独行者开局，后面加了纪律团杀了不少自由团，是不是这个原因让我直接坏结局了

你玩过原版吗，去许愿就是坏结局。还有你根本就没接主线

我玩的最后是到控制室捡取黑石碎片，接着回到老西那主线剧情结束，开启后续隐藏阵营剧情。原版主线大概流程是在老西接任务-追踪史特略洛克踪迹-下实验室关闭焦脑器-切尔诺贝利核电站。你玩的整合包可能是添加或改动了剧情，你可以到B站搜下原版攻略。看下任务流程是否有什么遗漏。

关了焦脑器之后应该去河湾地区找恶棍了吧，他在斯卡多夫斯克号上。你没有任务提示？还是说你压根就没接主线啊。

大伙说的主线包含三个任务：永恒传奇—致命原罪—霞光（余晖）行动，这个是从阵营指挥官那里接到的任务。一般来讲不会没有。