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生物医学检验:TRIZOL法提取细胞中的总RNA

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TRIZOL是一种总RNA抽提试剂,TRIZOL在破碎和溶解细胞时能保持RNA的完整性,是最常见的RNA提取方法之一。
2、实验试剂及原理:
(1)TRIZOL含有苯酚、异硫氰酸胍等物质,能迅速破碎细胞并抑制细胞释放出的核酸酶。TRIZOL的主要成分是苯酚。TRIZOL在破碎和溶解细胞时能保持RNA的完整性,因此常用于对纯化RNA及标准化RNA的生产。
(2)氯仿:其作为有机溶剂可以快速破坏细胞、使内容物释放、去除匀浆中的脂溶性杂质;可以抑制RNA酶的活性,并使蛋白质变性,易于通过离心去除。
(3)异丙醇:用于增加RNA局部密度,作为RNA的沉淀剂。
75%乙醇:有机溶剂,无脱水作用且挥发性好、通过相似相溶的原理达到洗涤RNA沉淀的作用。
(4)DEPC水:不含杂质和RNA酶,作为RNA溶解的溶剂。
3、耗材要求:
操作所用的EP管、枪头等应选用无酶产品。
4、实验步骤:
(1)提取细胞样本:在倒置荧光显微镜下观察细胞,选取镜下生长状态良好且贴壁细胞密集分布的细胞培养瓶;使用PBS缓冲液冲洗细胞2次。再加入1.5ml PBS缓冲液润洗,并使用细胞刮刀轻轻刮下贴壁细胞。使用移液器转移至1.5ml 无酶EP管。放入离心机常温,1500rpm,离心五分钟。吸去上清液,加入1ml TRIZOL吹匀,冰上静置至充分裂解(5-10分钟即可)。
对于在6孔板、24孔板等细胞数量少的容器中培养的贴壁细胞可以先用PBS洗涤后,TRIzol可直接加入孔中,待充分裂解后,再移入EP管,进行后续操作。
组织样本:则选取新鲜的或-80℃冰箱和在液氮中冻存的组织。用干净的剪刀镊子剪取50mg左右组织充分剪碎,加入1ml TRIZOL,使剪碎组织要充分接触裂解液,组织匀浆7000rpm,15s、3次;室温放置五分钟;再最大离心速度瞬离,转移上清液至EP管中。
(2)加 200μl氯仿,上下颠倒混匀至冰沙状,冰上静置5 min。使用低温高速离心机12000 rpm,4 ℃, 离心15 min。
离心后的EP管分成三层,用移液枪吸取最上层上清400-500μl移到另一个新的EP管中。
若三层分层不清:如离心分层结果不理想、转移中发生颠簸,等应重新离心;吸取过程中枪头触及上清液以下区域应将上清液打回,重新离心。
(3)再向其加入400-500μl异丙醇(与上清液体积比为1:1),上下颠倒混匀,冰上静置至RNA充分沉淀。12000 rpm,4 ℃离心10min。
(4)弃去上清液,用加入1 ml 75% 乙醇(无水乙醇与RNase的水配制)混匀。7500rpm,4 ℃离心5 min(为提高纯度可再重复此步)。
(5)弃去上清液,冰上放置晾晒五到十分钟,用小量程移液器再次吸取残留液体。用枪头边缘刮净或用脱脂棉签EP管边缘液滴,放置至液体挥发干净(不可完全干燥,否则沉淀可能无法溶解)。
(6)加入适量DEPC溶液溶解RNA白色沉淀,使其重悬。重悬后的液体可以65℃孵育5min,轻柔混匀。
5、RNA完整性的鉴定:
(1)使用紫外分光光度计测量RNA样本的浓度。
RNA样本OD260/OD280的比值在1.8到2.2之间,OD260/OD230的比值在2以上,则样本质量良好。
通常认为:OD260/OD280的值1.8-2.2之间纯度良好;小于1.8则可能有蛋白质残留;大于2.2则可能有RNA的降解。
OD260/OD230的比值在2以上样本无污染。小于2.0则可能存在盐离子的污染。
(2)配置无酶化的电泳缓冲液及1%EB琼脂凝胶;并对电泳槽等设备进行无酶化处理。
(3)将样本加入1% EB琼脂糖凝胶中,90-110V的电压下恒压电泳。
(4)凝胶成像仪下成像,出现三条清晰的RNA电泳条带28s、18s、5s;28s条带的亮度大致为18s条带的两倍,说明RNA完整性良好。
6、RNA的保存:
提取RNA或重复使用样品时,可能会引入少量的RNase污染。正确的保存可以减少RNase污染和随之而来的样品降解。可使用DEPC水溶解RNA或用水性缓冲液溶解沉淀并存储于-80℃。常用缓冲液包括:含0.1mmol/L EDTA的DEPC水或商品化的RNA储存液,RNA在-80℃下可稳定保存1年。
当从存储状态中取出RNA时注意冰上解冻,若样本过多,注意按照需要分装,防止反复冻融对RNA的损伤与暴露于RNase的污染。


IP属地:河北1楼2024-01-03 15:18回复