在某些情况下，局总工程师和副局长之间存在职位高低的关系。一般来说，副局长是行政领导职务，而总工程师则是技术管理职务。两个职位的职责和工作内容不同，因此无法直接比较谁高谁低。如果从组织结构的角度来看，副局长通常负责整个局的日常管理和决策制定工作，其地位可能高于总工程师；然而，在一些特定的行业或领域中，如高科技产业、信息技术等部门，总工程师的技术能力和专业背景往往更加重要，因此在这些行业中，总工程师的地位可能会比其他行业的副局长更高一些。此外，每个单位都有不同的组织和分工方式，有些单位的总工程师可能是由局长兼任或者是由专业技术较强的人员担任，这种情况下也可能不存在职位的高低之分。