故事发生在零镇结束的若干年之后，一天黑骑监测到不明机体，结果发现是高文兰斯洛特和红莲，驾驶人分别长着棕色头发，红色头发，绿色头发和亚麻色头发，他们将黑骑击落，来到了神根岛，并让绿色头发的女孩开启了遗迹。

镜头给到鲁路修和阿尔(游戏男主)，两人正在讨论反派的种种行为和目的，鲁路修表示已经让人改装了机甲。另一边，朱雀正在和娜娜莉闲聊，两人也聊到鲁路修让人改装机甲的事情，聊到一半地面突然开始摇晃，娜娜莉以为是地震了，朱雀安慰了她之后惊讶地发现高文从天而降，并且从高文上下来了一个女孩子，朱雀跑过去确认了那个亚麻色头发的女孩没有受伤，然后把她带到了娜娜莉身边，那个女孩没说几句话就对着娜娜莉喊妈(喊了两遍)

绿色头发的女孩和博士到了一个地方，却并不是记载中的c的世界，突然反派ZERO(非鲁路修)登场，业雀也出来露了个脸。棕发男孩和红发女孩也来到了这个地方，两人发现另外两个姐妹不见了，打算分头寻找。

红发女孩来到了一个研究所，明显是研究机甲的地方，这时她听到有脚步声，立刻躲了起来，进来的是布丁，塞西尔和拉克夏塔，在他们的交谈中红发女孩意识到他们面前的红色机甲就是母亲卡莲的所有物。突然，玉城发现了她，为了不被抓到她只能打晕玉城，此时扇，柯内莉亚，吉尔福德等人也走了过来……棕发男孩来到阿修福德学园，刚到这里就被米蕾拜托抓猫，抓到猫之后被狠狠咬了一口(不愧是朱雀的孩子)，穿着校服的尤菲，罗洛，立瓦尔，夏莉，卡莲也登场，带朱雀儿子去了保健室处理伤口

朱雀和娜娜莉询问亚麻色头发的女孩从哪里来，女孩说是从神根岛来的，但是女孩对遗迹和观测的事情一概不知，正当他们发愁的时候，鲁路修，cc和阿尔登场，鲁路修和cc都确认了女孩的高文不是他们的那一个，接下来是整个活动最乐的地方，我直接把对话打出来:
女孩:爸爸！
鲁路修:哈?
阿尔:鲁路修是爸爸?
女孩:对，鲁路修是我爸爸。
朱雀:你等等，但是你刚刚不是叫娜娜莉妈妈吗？
女孩:对，我爸爸是鲁路修，妈妈是娜娜莉。
娜娜莉:你是我和哥哥的孩子?
女孩:是的，妈妈。
cc(气到立绘发抖):鲁路修，你……
鲁路修:等等，等等，我什么都不知道。
朱雀:这么一说，脸和气质，都跟鲁路修和娜娜莉一模一样。
鲁路修:喂，朱雀，不要火上浇油！阿尔，你知不知道什么。
阿尔:欸，这个时候提到我，就算你这么说，这孩子也不是我观测的故事里面的……
娜娜莉:你能把手给我一下吗？
女孩:诶?妈妈的话倒是无所谓。
娜娜莉:啊，你没有在说谎。
女孩:当然了，我没说谎。
cc:听见了吗，鲁路修。
鲁路修:我说，稍微等等！

地点:研究所
玉城和扇正在讨论红发女孩的处理问题，柯内莉亚认为女孩没有敌意，女孩认出了柯内莉亚，但是表示柯内莉亚比她之前看到的要年轻，众人意识到她是从未来过来的。
镜头又给到娜娜莉女儿这边。
娜娜莉女儿告诉鲁路修，是她姐姐开启的遗迹，她有一个哥哥和两个姐姐，来这里的目的谁都没有告诉她。鲁路修他们决定和女儿一起去找她的哥哥。
哥哥这边:
上好药之后，米蕾就邀请他参加活动，大家都做了自我介绍，在闲聊中他得知面前的人认识鲁路修和朱雀，大家相谈甚欢，突然学园遭到袭击，几人赶紧出去迎敌

好好好，大爱兄妹

纯纯逆天

接下来我记得是朱雀鲁路修指导小孩作战来着，具体的等我再看看

哥哥，姐姐

那个博士给朱雀儿子和娜娜莉女儿身上装了炸弹，以此来要挟他们对抗鲁路修。鲁路修也得知了这些孩子的来历，是提取了他和朱雀，cc，卡莲，娜娜莉的基因做出来的，并且想出办法打败了博士，取出了孩子们身体里的炸弹，给他们办了一场生日会