在奥特曼格斗进化3中，设置技能需要先选择对应的奥特曼，并在技能装备界面中选择合适的技能进行设置。在选择技能时，需要考虑技能的属性、威力和消耗等因素，以确保在战斗中能够发挥最大的作用。另外，还可以通过升级和强化技能来提升其效果和威力。