蛋白质工程和细胞工程都是指利用生物学原理和技术，将化学物质转化为生物产品的过程，但它们有一些重要的区别：目的不同：蛋白质工程的目的是为了获得具有特定生物学功能的新蛋白质，或为现有蛋白质的改良提供新的方法。而细胞工程的目的是为了获得新的生物产品，例如疫苗或药物。技术基础不同：蛋白质工程涉及到化学和生物物理学等多个学科的交叉，它利用了化学物质的生物学活性和生物学原理，以及生物学技术，使其能够在工程上得到实现。而细胞工程则是指将细胞作为生物反应器，进行生物技术的开发和生产。应用领域不同：蛋白质工程应用于生物医学领域，如疫苗制备、诊断工具、药物研发等。而细胞工程则应用于工业、农业、环境保护等领域，如利用细胞培养技术生产药物、生物燃料和其他农业材料。性质不同：蛋白质工程具有生物分子特性，如功能性、生物学活性等。总之，蛋白质工程和细胞工程最本质的区别在于其目的不同，并具有不同的应用领域和性质。