资源配置中的方式包括自然配置和人为配置。自然配置是指资源在自然环境中的分布和利用，如水、土地、森林、矿产等资源的分布和利用。人为配置是指人们根据社会和经济发展需要，对资源进行有计划的分配和利用，如国家制定的资源开发规划和项目实施计划等。计划配置是人为配置的一种形式，但并不是资源配置中的全部方式。