计算营运车停运损失的方法是计算出停运期间的收入损失以及停运造成的费用，然后再将它们相减得出损失的总金额。具体来讲，可以拿停运前后的收入，减去停运后的收入，从而得到该期间收入损失，此外，需要将该期间与停运有关的费用也加进去，比如修理费、改造费等。最后，将收入损失与费用相减即可得出营运车停运损失的总金额。营运车停运损失除了要考虑收入损失和费用之外，还要考虑一些间接性损失，比如客户流失、声誉损失等。停运时期的及时补救措施和改进措施的落实，也会影响最终的损失金额。