在与黑衣组织的决战关头，柯南告诉小兰真相，主角团心领神会，经过重重曲折联合抢到解药，在黑衣组织团灭以后，柯南小哀玛丽放心服下
柯南变回新一，小哀变回志保，二人首先回小学告诉三小只真相，天真的孩子们哭着舍不得他们，但最后还是强撑笑容，还是一起喊着“新一哥哥、志保姐姐”，并帮他们拿行李，在夕阳下一起去小兰家
毛利夫妇已经从小兰口中知道真相，都表示理解，毛利更是表示当年的1K万根本没花，早就存银行，年年利息也够了，并作为感谢还回去，不管对方的推辞，还半开玩笑“哈哈哈哈，以后再也不是沉睡的小五郎了”，像是在笑，却更像是在哽咽
此时的小兰则依旧保持原本温柔的微笑，好像一切都没有发生过，新一并没有挨棍，也没有变小，也没有遇险，好像云霄飞车还是昨天的事情，此时园子也在场，虽然依旧吐槽，但细细看着，她的双眼仿佛有什么东西在闪烁
这时，外面有人敲门，又是那熟悉的关西腔“工藤”，平次进来开门见山：“我跟她表白啦，可不输你的清水寺”，事务所里的感伤气氛得到了些许缓解，但大家都知道，曾经用关西方言掩盖“工藤”发音的日子也一去不复返了
志保和赤井一家在秀吉由美的婚礼上相认，最后和玛丽、秀吉夫妇、世良四人，移居英国，并继续进修，多年后成为牛津大学的终身教授，主攻科研
秀一还是留在霓虹，茱蒂则回到阿美丽卡，一别两宽。
水无和茱蒂一起走，前者在找到弟弟后便移居，在阿美丽卡某个电视台当主持人，后者依旧在FBI工作。
佐藤高木、白鸟小林、千叶苗子、重悟千速在他们移居英国后也结了婚，高木辞职当家庭主夫，小林依旧是老师，千叶苗子、重悟千速也各司其职
知道真相的安室依旧以毛利为师，也仍然在咖啡厅工作，既然黑衣组织团灭，“波本”的代号也成了过去，便也跟警视厅说他卧底的真相，在高木辞职后便接任其位置，由于高超的业务能力，薪水漂亮，工作轻松，很快又升了级，但每年都会有那么几日一个人去墓园，并沉默良久
敢助和由衣终究没有在一起，毕竟都是经历过世事沧桑的成年人，感情对于他们来说，就算开了口，也倍感沉重，且长野事务繁忙脱不开身，但仍是合作融洽的同事，三人都没有单飞
青梅竹马们你侬我侬，一起考上了大学，热恋中的他们，竭力抓住青春的尾巴
但是，多年后…
她们最终的结婚对象都不是他们，而他们，也最终跟曾经陌生的女孩成婚，从此与她们山高水长，天各一方
赤井安室，茱蒂水无，长野三人组，依旧未婚
毛利夫妇依旧分居，目暮松本黑田等人也退休了，几个人时不时聚一聚
曾经不懂事的三小只也长大了，他们有了新的朋友，有了新的学段，更有了忙碌的学业，童年时期的冒险终究无法伴随一辈子，但每当落寞的时候，都会找曾经的哥哥姐姐们通话寻求帮助，或者去找阿笠博士。
成年后的他们也结了婚，和曾经的哥哥姐姐们通话的次数和时间便越来越少，不过就是三个人偶尔带着配偶、孩子们聚一聚，但都不是曾经的样子了
而远赴英国的他们，生活也渐渐归于平淡，除了偶尔和赤井通个话以外，三小只结婚后他们跟其他人也渐渐淡了联系，志保世良姐妹，一个专注于研究，一个专注于截拳道和侦探工作，都成了当地的名人
而面对外界对她们个人生活的猜测，她们都表示，没决定好（已经很委婉了）
又过了好多年…
曾经意气风发的他们，都老了
曾经叱咤风云的他们，都去世了
整篇故事，也就结束了
【完】