要清理蜂箱里的垃圾，最安全的方式是使用金属工具并谨慎动作。首先，使用金属工具将蜂箱外壳细心地拆卸，让蜂箱内部暴露出来，其次，用金属工具将蜂箱内部的残留物慢慢清理，有可能触碰到蜂群时，反复抬高放低来使蜂群更随意，第三，将清理完毕的蜂箱装回壳体，关好壳体，堵住各个洞口以免蜂群再次逃走。清理蜂箱的同时，还应该对蜂箱打扫卫生，更换新鲜食物，检查蜂箱内外环境，以确保蜂群良好健康的生活状态。