一些重要的设定：
1、契约是各个模拟宇宙之间的通讯协议，保证各个宇宙既联通又相对独立。契约的设定类似于互联网通讯协议
2、故事中，在低等级的宇宙中新诞生的意识体死后是无法存在于高等级的宇宙中，唯有从高等级低宇宙来到低等级宇宙的意识体死后才可能回到高等级宇宙中。梁灿的母亲周稚博士死后自动升级到D50宇宙就说明了这点，而梁灿由于是E5001宇宙中新生的意识体，他不能看见高等级宇宙中的“光”，所以无法离开E级宇宙前往更高等级的世界。这个设定应该源于濒死体验，部分人休克了也会看见一条通道，通道的尽头散发光芒等濒死体验；然而另一部分休克者却没有濒死体验，被抢救回来前一直是无意识状态，整个过程就像无梦的深睡。死后意识去了另一个世界的设定明显对应于宗教中“天堂”即神存在的世界。话说回来，故事中的“神”在高等级的宇宙中也不过是普通人。因此在A0000死去是卓凛回到真实世界最后的手段。
3、契约大会中的文明无一例外发展到一定阶段就会因个体私欲的极大满足而失去发展动力，看来作者是支持用“大过滤器”理论解释费米悖论。
4、为什么“契约计划”最终失败了？叶子和水面的比喻是典型的牛顿时空观，而涟漪的比喻是典型的莱布尼茨时空观。在牛顿时空观中，时间、空间、物质都是独立的存在。而在莱布尼茨时空观中，时间、空间无法独立于物质而存在，反之亦然。看来作者更认可莱布尼茨时空观，在这个时空观下物质当然是不可能逃离宇宙的。

5、关于卓凛为什么会意识分裂。这可能不完全是翅膀姐姐导致的，也许是A0000之外的真实世界的系统刻意安排的。薛定谔的猫在“真相之路”篇章中反复出现，暗示了了这一点，在得到最终结论之前，一切都不确定，所以会有两个卓凛在不同的方向上探案答案（一个代表普通人，另一个代表人工智能），直至结论确定后她们才会合二为一。
6、最终话中，卓凛回到现实世界是从某种液体中醒来，脖子上插着的管线弹出，这一幕是不是很像《黑客帝国》？没错，就是在模仿《黑客帝国》。再通过最终话中“所有数据导出结束，核心权限归零”可以确认A0000宇宙依然不是真宇宙，A0000到头来也是用来实验人类发展方向的策略模拟。
7、卓凛的不可预测性源于物理世界的真随机，作者应该是参考了真假随机。由计算机中算法产生的随机通常被认为是假随机，知道算法就可对随机现象进行精准预测；而由物理世界中量子现象产生的随机通常被认为是真随机，无法预测。

结局的解读：
“契约计划”的失败是否意味着人类会困死在宇宙中直至文明毁灭？
我理解下来认为不会。虽然卓凛最终没有给出“契约计划”的想要的答案，但刘柯柯还是承认卓凛是个比最终结论更好的发现。故事中反复强调卓凛的不可预测性、特殊性。说明了真实宇宙和模拟宇宙存在本质不同，真实世界有着无限的可能性。而再强大的智能（无论是人、外星人或是人工智能）都无法在模拟宇宙中得到想要的答案的，想要知道答案唯有实践一条路。
其次，作者对于故事中真实世界中的人类的态度还是很乐观的。第142话《舍我其谁的人》第一次点明这点。此外，最终话里“今日要闻滚动”中，可以看到这个世界中的人类已经掌握了“禁止的知识”——可控核聚变和无比强大的算力，但他们并没有完全沉溺于虚假的满足中，而是进行星际移民、继续探索星辰大海。总结起来，作者的观点很大概是：我不能给出终极问题的解决方案，但我相信在无限的可能下人类未来可以做到。
最后一点，人类文明的宏观视角和每个个体的微观视角并非不能共存，从故事中作者并没有特别偏袒某一方势力且对各方势力的典型人物都做了刻画能够看出这一点。有能力、有远大抱负者就去实现宏图大业，而大多数普通个体追求平凡的幸福也无可厚非，每个人都应该各得其所。主角卓凛一开始就设定为一个及其普通的高中生，到故事结尾终于找准了自己的人生定位，始于平凡终于平凡，平凡的个体只需抓住平凡的幸福就好啦。

一些有趣的设定：
1、严酥很明显是耶稣的谐音，这样看来严酥是2000多年前才成为E5001的神。注解：模拟宇宙中的时间流逝速度肯定和真实世界中不一样。
2、此漫画于2012年开始连载，也是玛雅预言中的世界末日发生之年，作者因此才编出严酥被审判、末日来临的剧情。2012年末开始就是“卓凛元年”了。
3、“42”这个梗源于《银河系漫游指南》，指生命、宇宙以及任何事情的终极答案。在漫画中，42成为全宇宙中地球发展水平的文明数量。

看了你的分析完全看懂了，作者也好厉害 可是后面就没有再画漫画了。要是这部漫画能动漫化就好了

这个分析厉害了！