在专利大战受挫同时，Illumina宣布将涉足药物研发领域。Illumina宣布与投资公司Deerfield Management达成了一项五年期合作，利用基因组学和人工智能识别药物靶点并加速新疗法的开发。对此，一位诊断试剂企业CEO向21世纪经济报道记者指出，作为药物发现关键的工具提供商，现在入场尝试自己制造新药，原本售卖“镐和铲”的公司现在要自己下场掘金了。
“专利官司在技术领域比较常见，但这也其实说明有竞争。临床的应用短期支撑不了那么高的测序需求，需要新的增长点，llumina一直有做应用的冲动，但目前还没有特别成功的，对此我持谨慎态度。具体到做药物靶点开发，核心是硬件之外的数据、算法和验证平台，llumina或希望带动孵化这个领域，期待未来有个大的下游应用市场带动设备销售。”上述CEO表示。
被判赔3.338亿美元
该起诉讼案始于2019年5月，华大智造美国子公司Complete Genomics（简称“CG”）向美国特拉华州地区法院提起诉讼，起诉国际基因测序巨头Illumina侵犯了Complete Genomics的two-color测序专利。

其中，该涉案专利的美国专利号是9,222,132- Methods and compositions for efficient base calling in sequencing reactions（简称“132专利”）。这项专利是华大智造专有的two-color测序专利，是实现高通量、高质量测序的核心技术之一，也是华大智造DNBSEQTM测序技术中的关键技术。几个月后，CG又指控Illumina 侵犯了473 专利。
华大智造称Illumina公司包括NovaSeq 6000、NextSeq 系列、MiniSeq在内的多款基因测序仪及相关试剂均涉嫌侵犯该专利。华大智造在诉求中要求Illumina停止侵权，同时申请了永久禁令，要求后者立即停止销售上述侵权的产品，并且赔偿损失。
随后，Illumina, Inc.和Illumina Cambridge Ltd.于2019年7月25日提起反诉，主张CG US、华大智造和美洲智造侵犯其三项专利权：US9217178B2- Method of nucleotide detection、US9303290B2- Method of nucleotide detection和US9970055B2- Method of nucleotide detection。

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