1995年9月,广西自治区体校教练苏国培到柳州市体校选拔队员,挑中了朱芳雨。苏教练对他进行了骨龄检测,预计其身高能达到2米,是块打篮球的材料,因此对他进行了重点培养。身体素质和基本技战术一起抓,使得他得以健康成长。1998年9月,年仅15岁的朱芳雨进入广西男篮。同年底,为了寻求更大的发展空间,由柳州市体委朋友牵线,进入广东宏远青年队,同年12月随队去郑州参加全国青年队冬训,而被国家青年队相中。99年,朱芳雨成为宏远正式队员,由于未办妥转会手续,当年没被允许注册。2000年至2001年赛季,他代表宏远队出现在CBA赛场,在逐渐成为队中绝对主力的同时,也成为CBA赛场上一颗冉冉升起的新星。