马继援生于1921年1月18日，12岁时，由南京中央军政部委任为青海省南北边区警备司令部上校参谋长。1934年任第100师手枪团第1连连副，翌年升为连长。1936年历任第100师部参谋，青海南部边区警备司令参谋长，骑兵第5军及82军军官训练团第3大队大队长，国民革命军陆军上校军衔。1937年任陆军第82军骑兵第3旅旅长，同年4月28日任青海省参议会秘书长。
可能没几个人知道，在民国后期，马继援是响当当的，曾被蒋介石寄于厚望，在西北的作用比胡宗南都重要。