实际上，单是整理出《第二基地》第二部分的第二基地计策，就比整理出前两部加《第二基地》第一部分的所有计策之和还要复杂。

第二基地为了应对骡的突然意外崛起，临时在大本营川陀暗中研究了骡的精神控制能力，然后暗中精神控制女主角贝泰杀死即将公布第二基地位置的老科学家从而阻止了骡。

为了阻止骡靠自己的力量找到第二基地和消灭他对谢顿计划的意外影响，第二基地设计自己的间谍程尼斯被精明的骡暗中识破，然后让程尼斯在不知情的情况下带着骡和他的舰队追踪到第二基地设计好的假冒第二基地
。
第二基地一方面派大队人马趁虚而入骡的大本营，随时准备出手瓦解骡留在他主力军队上的精神控制，另一方面故意让骡打败三流间谍程尼斯从而获得进一步的情报——程尼斯引骡前往的地方不是第二基地，这个冒牌货旁边的附属星球才是第二基地。
然而，那个附属星球也是第二基地设计好的假货，
第二基地通过双层陷阱，让多疑的骡认定找到了第二基地。
最后，由第二基地第一发言人亲自出马，一方面以第二基地大队人马已经控制骡的大本营为后盾，另一方面告诉骡真相——间谍程尼斯引骡而来的星球不是第二基地，骡自己从程尼斯心底挖出来的附属星球也不是第二基地。
程尼斯是被第二基地改造的特工，他自己都被第二基地灌输了假信息，他自己都以为附属星球是真的第二基地，以为自己的使命是欺骗骡相信附属星球的控制星球是第二基地，以保护附属星球。

《第二基地》第一部分，是建立在第二基地故意派出三流间谍程尼斯做诱饵，让骡识破然后自己闯进第二层伪装的基础上的。

于是第二基地花费十五年时间设计了更加复杂的长期计划，以补救之前临时起意的消灭骡行动的副作用。
他们首先派出大批间谍了解基地和其他重要人类世界的情况，特别是监视基地科学家偏离物理学而向精神控制学的意外转化，以防止基地最终掌握精神控制科学反过来对抗第二基地和进一步偏离谢顿计划。
为了消除基地科学家的这种趋势，间谍们精心设计接近了最先有研究第二基地和精神控制学科的几个基地人员，然后促成他们和间谍安索一起主动进行实际性研究。

第二基地的间谍安索的任务是促成基地科学家放弃对精神科学的研究。为此他假装倡议研究者之一前往索尔根星球，让他受到精神影响而得出错误结论——第二基地不存在。如果其余研究人员都相信了这种说法，那么基地也就等于放弃了对精神科学进行研究的动力，第二基地就可以成功继续隐藏下去。
这就是第一层陷阱。

第二层陷阱，被精神影响、认定第二基地不存在的研究者应该不太可能被其余研究者认同，于是间谍们设计安索主动揭穿他，然后自己主动给出假结论——第二基地就是骡曾经的大本营卡尔根。
受到研究者之一在卡尔根被精神影响的震动，其余研究者很可能接受间谍安索的结论，认定卡尔根是第二基地。
这就是第二层陷阱。

然而，由于主要研究者达瑞尔有很强的警惕性，他拒绝被间谍安索说服，去卡尔根救自己的女儿，反而留在基地继续研究，甚至成功发明了屏蔽精神控制和能够严重刺激精神控制者的科学装置。
这种装置将继续使历史发展偏离谢顿计划，进一步威胁第二基地。
也就是说，直到此时，达瑞尔和研究者们仍然不在第二基地的控制下。
为此必须按照原来的宏观规划，牺牲安索和其他间谍，让达瑞尔通过他发明的科学装置现场揪出安索，让他告知整个基地第二层陷阱的真相。

我最喜欢的也是第二基地，悬念迭起，结尾出乎意料又在意料之中

牺牲安索和其他49名间谍，就是第三层陷阱，也就是第二基地原定的真正一层骗局。
通过牺牲安索等人，再利用自出生就被精神影响的达瑞尔之女艾卡蒂在关键时刻送达的口信，引诱达瑞尔自己推导出错误结论——第二基地就是那50个间谍而已。
为了防止第三层陷阱被达瑞尔识破，就要安排他女儿从出生就被精神影响，这样就不会被安索提供给达瑞尔的识别方法发现。达瑞尔女儿艾卡蒂被刻意隔离到遥远的川陀世界，然后透过第三人将艾卡蒂受精神影响而得出的假结论在达瑞尔的研究即将触及真相之前，发给他，让他得到错误的结论。

把达瑞尔的女儿自出生起就精神影响，让她变成一个难以被侦测到的错误结论引导人物，这是第三层陷阱的第一个节点。

第三层陷阱的第二个节点是，让达瑞尔和他的女儿隔离，然后把她女儿受精神影响而得出的错误结论在达瑞尔完全发现第二层陷阱后的得意时刻，送达给他，引导他认定第二基地就是隐藏在基地的那50个间谍。

第三个节点是，故意让间谍安索把半真半假的精神影响鉴别方法很早就告知达瑞尔和其他最早主动研究第二基地的人物，由此，达瑞尔等研究者落入了一个计中计——他们以为受到精神影响就一定被“脑电波高原”方法检测出来，却不知道如达瑞尔之女那样，从小就被影响的人，是这种方法侦测不出来的。

由此，最早触及研究中心的达瑞尔完全陷入了逻辑困境。
达瑞尔拒绝安索的建议，不去川陀世界救女儿，本意就是想避免陷入第二基地可能的陷阱——如果他去了，就不能继续研究，造不出来对抗第二基地的科学装置，而最早在卡尔根被精神影响的研究者的错误结论——第二基地不存在，可能被所有研究者和基地世界接受。
如果达瑞尔不去川陀救女儿，继续研究，那么他可能研究出来对抗第二基地的科学装置，甚至发现第二基地的真相，所以必须抢先在关键时机把他女儿的错误口信传给他，让他得出错误结论，再以牺牲安索等间谍为代价，让他进一步坚定这个错误结论。