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第二代高通量基因测序系统简介

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第二代高通量基因测序系统简介
对于每个生物体来说,基因组包含了整个生物体的遗传信息。
基因测序仪应用新型基因检测技术,能够真实地反映基因组DNA上的遗传信息,进而比较全面地揭示基因组的复杂性和多样性,广泛用于临床医学、生物能源、生命科学研究等领域。
第二代基因测序技术的核心思想是边合成边测序,即通过捕捉新合成的末端的标记来确定DNA的序列,目前第二代测序系统的主要缺陷在于由DNA簇中存在的光学信号移相造成的读长较短的问题。针对这一难题,我公司研制出了新一代的第二代高通量基因测序系统。
本公司的测序系统预期技术性能指标达到平均读长1000bp,读出序列数量达到40万条,单次运行数据产量400Mb,单次反应可实现8株细菌或1株真菌的全基因组测序,结合计划开发的自动化建库和靶向性测序系统,单次反应可实现96人份靶向性测序分析工作(每人份80个基因片段,50倍重复率)。设备尺寸约700mm×500mm×600mm(宽高深),实现桌面型测序仪系统功能。
根据测试实验获得数据进行分析得到,单个模块产生的有效读出序列数量约为30万条,平均序列读长≥650bp,数据总产量约为200Mbp,运行时间为20小时。数据精确性约为99.5%。
目前本系统是第一台能够达到和部分超越国际主流设备技术指标的国产化第二代测序仪。
目前国际上仍以第二代基因测序仪为主流,与第一代基因测序仪相比,其测序速度更快,成本更低。其缺点是由于DNA簇中存在的光学信号移相造成的读长较短的问题。这正是第三代单分子测序平台所需克服的关键点。
第三代单分子测序平台方面目前只有Helicos Biosciences公司开发的HeliScope遗传分析系统和Pacific Biosciences公司的RS系统投入市场,但在应用上、市场反应上均未取得良好效果。而Life Technologies、Mobious Biosystems等公司的第三代测序系统也仍然处于研究当中。


IP属地:北京1楼2014-05-04 10:43回复
    本公司的测序系统预期技术性能指标达到平均读长1000bp,读出序列数量达到40万条,单次运行数据产量400Mb,是第一台能够达到和部分超越国际主流设备技术指标的国产化第二代测序仪。
    与国外第二代高通量测序系统相比,在“读长较短”这一第二代测序系统的关键难题上,我公司的基因测序仪已达到领先水平。而国内的其他第二代基因测序仪,尚未解决此难题。同时我们的仪器还有通量大、实验周期短、实验成本低等其他国内仪器所不具有的优点。
    成本方面,我们由自主知识产权核心、器件模块化微量液流控制系统、自主知识产权核心试剂和自主开发的软件和数据库实现了效率和成本的最佳配置,打破了国外厂商垄断造成的高昂成本壁垒,所需成本低于进口设备的1/2以上,应用成本低于进口设备的1/3以上。
    根据测试实验获得数据进行分析得到,仪器单个模块产生的有效读出序列数量约为30万条,平均序列读长≥650bp,数据总产量约为200Mbp,运行时间为20小时。数据精确性约为99.5%。利用该系统对海洋中温菌新种Glaciecolamesophila进行了全基因组测序和分析,研究结果已发表于《Science China Life Sciences》杂志,获得了国内外同行的认可。


    IP属地:北京2楼2014-05-04 10:43
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